Нейросети для анализа ДНК: модели AIRI для геномики и вирусологии
Краткое изложение интервью, опубликованного в сообществе «Врачи РФ» от .
В интервью биоинформатик Института искусственного интеллекта AIRI рассказала о нейросетях для анализа генома и вирусных белков. Разработанная ее группой модель DeepCT прогнозирует возможную роль мутаций в разных типах клеток, но пока не является клиническим инструментом, а ее результаты требуют проверки. Модель GENA выявляет закономерности в последовательностях ДНК и доступна исследователям: ее версии обрабатывают около 3000 и 24 000 нуклеотидов; за последний месяц их скачали более 1000 раз.
Архитектуру RMT разработали в AIRI совместно с коллегами из МФТИ. Она справлялась с последовательностями длиной 1–2 миллиона букв в ряде задач, а возможность анализа геномных данных на отрезках более 24 000 букв пока изучается. Нейросеть SEMA, созданная с коллегами из центра Гамалеи, выявляет эпитопы и гликаны на вирусных белках; собеседник сообщила, что модель применима для изучения разных вирусов.
Главное
- DeepCT прогнозирует возможную роль мутаций в разных типах клеток; ее предсказания требуют проверки.
- Версии GENA обрабатывают около 3000 и 24 000 нуклеотидов и доступны исследователям.
- Архитектура RMT разработана в AIRI совместно с коллегами из МФТИ; в отдельных задачах она работала с последовательностями длиной 1–2 миллиона букв.
- SEMA выявляет эпитопы и гликаны на вирусных белках и, по словам собеседника, подходит для изучения разных вирусов.
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация