РНК-вирусы городской среды: атлас включил 54 945 таксонов из 102 городов
Краткое изложение публикации в сообществе «Врачи РФ» от .
Международное исследование 2 922 образцов из 102 городов 31 страны выявило 54 945 таксонов РНК-вирусов; 77% из них ранее не описывали. По результатам создан UPVAtlas — атлас РНК-вирусов городской и пригородной среды. Исследование опубликовано в Nature Communications.
В анализ вошли пробы с городских поверхностей, а также данные о почве, донных отложениях, пресной и сточной воде и теплицах. Для изучения образцов использовали метатранскриптомику. Потенциальных хозяев определили примерно для трети последовательностей; больше половины из них принадлежат вирусам бактерий. Сопоставление с базой VIRION указало на 60 вирусов, вероятно способных заражать человека; ещё 47 вирусов могут поражать других млекопитающих. Разнообразие вирусов в сточных водах оказалось одним из самых высоких среди изученных сред. Кривые накопления почти для всех типов образцов не достигли плато, поэтому каталог охватывает лишь небольшую часть вирусов исследованных мест.
Главное
- В исследование вошли 2 922 образца из 102 городов 31 страны.
- В UPVAtlas включили 54 945 таксонов РНК-вирусов, 77% которых ранее не были описаны.
- Потенциальных хозяев определили примерно для трети последовательностей; больше половины из них — вирусы бактерий.
- Исследователи выявили 60 вирусов с высокой вероятностью заражения человека и 47 вирусов, которые могут заражать других млекопитающих.
- Сточные воды вошли в число сред с наиболее высоким разнообразием вирусов.
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация