MetaFast для анализа метагенома: разработка ученых ИТМО, ФНКЦ и МФТИ
Краткое изложение публикации в сообществе «Врачи РФ» от .
Ученые Университета ИТМО, ФНКЦ физико-химической медицины и МФТИ разработали алгоритм MetaFast для быстрого сравнительного анализа метагеномов. Метагеном включает ДНК микроорганизмов, обитающих в одной среде, а его особенности могут указывать на заболевание или предрасположенность к нему. Программа собирает генетические последовательности из фрагментов прочтений, в том числе неизвестные ранее, и помогает выявлять различия между образцами пациентов. Это может использоваться для поиска потенциальных маркеров заболеваний и разработки персонализированных методов лечения. Результаты экспресс-анализа предполагается проверять целевыми методами, например ПЦР. Разработчики полагают, что применение MetaFast может ускорить создание новых лекарств в несколько раз.
Главное
- Алгоритм MetaFast разработали ученые Университета ИТМО, ФНКЦ физико-химической медицины и МФТИ.
- MetaFast предназначена для быстрого сравнительного анализа большого количества метагеномов.
- Программа выявляет неизвестные генетические последовательности и различия между метагеномами пациентов.
- Результаты экспресс-анализа маркеров заболеваний можно проверять с помощью ПЦР.
- Разработчики считают, что MetaFast может ускорить создание новых лекарств в несколько раз.
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация