Метаболомика: МГУ разработал схему анализа метаболитов с машинным обучением

Краткое изложение публикации в сообществе «Врачи РФ» от .

Химический факультет МГУ разработал схему анализа метаболома, которая помогает классифицировать образцы и определять минимальный набор биомаркеров для правильной классификации. Методика объединяет машинное обучение, статистический анализ и коррекцию дрейфа сигнала измерительных приборов. Для первоначальной настройки схемы использовали данные анализов 8 добровольцев, 20 пациентов с колоректальным раком до операции и 12 пациентов после операции; данные предоставил НМИЦ колопроктологии имени А.Н. Рыжих.

Разработку проверили на 36 наборах экспериментальных данных; обычно в подобных исследованиях используют три-пять наборов. По замыслу исследователей, схема должна стандартизировать анализ данных в метаболомике. Вычисления выполняются в одной программе на одном языке программирования; программа распространяется бесплатно, а расчёты можно ускорить параллельными вычислениями. Результаты опубликованы в журнале Analytical Methods.

Главное

  • Схема МГУ сочетает машинное обучение, статистический анализ и коррекцию дрейфа сигнала приборов.
  • Для первоначальной настройки использовали данные 8 добровольцев и пациентов с колоректальным раком до и после операции.
  • Разработку проверили на 36 наборах данных; обычно используют три-пять наборов.
  • Результаты исследования опубликованы в журнале Analytical Methods.

Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.

Войти Регистрация