AlphaFold2 и структура белков: результаты CASP14 и ограничения нейросети
Краткое изложение авторской публикации врача в сообществе «Врачи РФ» от .
Автор анализирует результаты CASP14 2020 года, где нейросеть AlphaFold2 компании DeepMind значительно опередила другие команды в предсказании третичной структуры белков. В конкурсе AlphaFold2 набрала 244 балла против 92 у ближайшего участника; медианный показатель точности составил 92 балла, а две трети моделей получили более 90 баллов. Автор подчёркивает, что CASP оценивал положение атомов остова белковой молекулы, но не аминокислотных радикалов, и что участникам предлагали отдельные домены, а не целые белки. Поэтому результаты AlphaFold2 не означают, что решены все задачи структурной биологии или что экспериментальные методы стали ненужными. По мнению автора, предсказания могут помочь исследователям, однако для подбора лекарств важны конкретные конформации белка. На момент публикации подробное описание алгоритма AlphaFold2 ещё не было опубликовано.
Главное
- В CASP14 AlphaFold2 набрала 244 балла, а ближайшая команда — 92 балла.
- Медианный показатель точности AlphaFold2 составил 92 балла; две трети её моделей получили более 90 баллов.
- Конкурс оценивал положение атомов остова белковой молекулы, но не аминокислотных радикалов.
- Автор отмечает, что результаты AlphaFold2 не означают решения всех задач структурной биологии.
- На момент публикации подробное описание алгоритма AlphaFold2 не было опубликовано.
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация