Hi-C-метагеномика для анализа кишечных бактерий пациентов реанимации
Краткое изложение публикации в сообществе «Врачи РФ» от .
Российские ученые применили Hi-C-метагеномику, чтобы получить геномы кишечных бактерий у пациентов, длительно находившихся в реанимации. Метод объединяет ДНК-секвенирование с определением пространственной структуры ДНК и помогает точнее связать гены с конкретными бактериями.
В исследовании изучили микробиомы двух тяжелобольных пациентов и собрали несколько десятков геномов, в том числе клебсиелл, энтерококков и патогенных клостридий. У обоих пациентов обнаружили примерно по десятку видов бактерий; исследователи отметили, что кишечное сообщество было существенно обеднено. Анализ генов может помочь оценивать потенциальную опасность бактерий, включая наличие генов устойчивости к антибиотикам и вирулентности. Ученые рассматривают дальнейшее применение метода для изучения микробиома и разработки более быстрых и дешевых способов диагностики инфекций в больницах.
Главное
- В исследовании изучили микробиомы двух тяжелобольных пациентов, находившихся в реанимации.
- С помощью Hi-C-метагеномики собрали несколько десятков геномов кишечных бактерий.
- Среди реконструированных геномов были клебсиеллы, энтерококки и патогенные клостридии.
- У обоих пациентов кишечное сообщество включало примерно десяток видов бактерий.
- Исследование опубликовано в журнале Frontiers in Microbiology.
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация