Сверхэкспрессия микроРНК: как Dicer может исказить результаты эксперимента
Краткое изложение публикации в сообществе «Врачи РФ» от .
Исследователи НИУ ВШЭ и ИБХ РАН установили, что сверхэкспрессия микроРНК может приводить к появлению изоформ, не предусмотренных дизайном эксперимента. Работа опубликована в журнале BBA. Неучтённые варианты микроРНК способны подавлять другие гены и приводить к неверной интерпретации клеточных механизмов, в том числе при изучении онкологических заболеваний.
При синтезе предшественника к его концу добавляются урацилы, а фермент Dicer преимущественно отрезает фрагмент длиной 22 нуклеотида. Поэтому в последовательностях длиннее 19 нуклеотидов место разрезания может смещаться. В эксперименте с miR-93-5p образовавшиеся изоформы подавляли экспрессию HMGA1, хотя стандартная форма miR-93-5p не нацелена на этот ген. По данным исследователей, полимеразная цепная реакция не позволяет надёжно обнаружить сдвиг; для этого требуется секвенирование.
Главное
- Исследование НИУ ВШЭ и ИБХ РАН опубликовано в журнале BBA.
- Фермент Dicer преимущественно формирует фрагмент длиной 22 нуклеотида.
- В последовательностях микроРНК длиннее 19 нуклеотидов урацилы могут смещать место разрезания.
- Изоформы miR-93-5p подавляли экспрессию HMGA1, не являвшегося мишенью стандартной формы микроРНК.
- Для обнаружения сдвига разрезания исследователи использовали секвенирование; полимеразная цепная реакция оказалась недостаточно чувствительной.
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация