Секвенирование ДНК: возможности PacBio, нанопор и синтетических длинных прочтений
Краткое изложение авторской публикации врача в сообществе «Врачи РФ» от .
Автор материала сравнивает технологии секвенирования ДНК PacBio, Oxford Nanopore, Illumina SLR и 10X Genomics, описывая их принципы и ограничения. При одномолекулярном секвенировании PacBio круговую молекулу можно считывать несколько раз: по объяснению автора, объединение проходов повышает точность. PacBio RS II, выпущенный в апреле 2013 года, обеспечивает более высокую пропускную способность и более длинные чтения ДНК.
При нанопоровом секвенировании последовательность определяют по изменениям ионного тока, возникающим при прохождении ДНК или РНК через пору. Автор указывает, что длина чтения может достигать 1 Мб, а вероятность ошибок составляет 15 %. Illumina SLR и 10X Genomics применяют штрих-коды, чтобы по коротким прочтениям восстанавливать длинные фрагменты. Автор связывает развитие методов секвенирования с повышением скорости и доступности геномных исследований.
Главное
- PacBio RS II выпущен в апреле 2013 года и обеспечивает более высокую пропускную способность и более длинные чтения ДНК.
- В технологии PacBio круговую молекулу можно секвенировать несколько раз, а объединение проходов повышает точность.
- При нанопоровом секвенировании последовательность определяют по изменениям ионного тока; длина чтения может достигать 1 Мб.
- Для нанопорового секвенирования в материале указана вероятность ошибок 15 %.
- Illumina SLR и 10X Genomics используют штрих-коды для восстановления длинных фрагментов по коротким прочтениям.
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация