Аффинность белок-белковых комплексов: нейросеть МГУ улучшила прогнозирование
Краткое изложение публикации в сообществе «Врачи РФ» от .
Исследователи биологического факультета МГУ разработали нейросетевую модель для оценки аффинности связывания белок-белковых комплексов. Публикация с результатами исследования вышла в журнале «PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics». Трёхмерная сверточная нейронная сеть предсказывает константу диссоциации по множеству межатомных расстояний между белками-партнёрами. На независимых наборах данных модель превзошла существующие аналоги в прогнозировании аффинности связывания. Модель также превзошла альтернативные подходы при оценке аффинности комплексов ACE2 с RBD-доменом S-белка вируса SARS-CoV-2, в том числе мутантных форм вирусного белка. Разработчики рассматривают алгоритм как средство оценки малоизученных белковых комплексов; его применение может сократить время и ресурсы на начальных этапах создания лекарств, основанных на белок-белковых взаимодействиях. Работа о комплексах RBD-ACE2 принята к публикации в журнал «Биофизика».
Главное
- Алгоритм на основе трёхмерной сверточной нейронной сети предсказывает константу диссоциации белковых комплексов.
- На независимых наборах данных модель превзошла существующие аналоги в предсказании аффинности связывания.
- Модель показала высокие результаты для комплексов RBD SARS-CoV-2, включая мутантные формы, и ACE2.
- Итоги исследования опубликованы в журнале «PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics».
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация