CRISPR-Cas9: РНК-шпилька повысила точность редактирования в 55 раз
Краткое изложение публикации в сообществе «Врачи РФ» от .
Исследователи Университета Дьюка показали, что короткий участок РНК, образующий шпильку на 5′-конце спейсера направляющей РНК, снижает нецелевую активность CRISPR. В среднем точность канонического SpCas9 из Streptococcus pyogenes на ряде нецелевых участков выросла в 55 раз. Результаты опубликованы в Nature Biotechnology.
Эффект проверяли на направляющих РНК для генов VEGFA и EMX1: активность редактирования на целевом участке существенно не менялась, а на нецелевых участках снижалась. Повышение точности со шпилькой также наблюдали для SaCas9 из Staphylococcus aureus и разных форм Cas12a. Авторы предположили, что шпилька мешает образованию комплекса РНК-ДНК при неточном совпадении последовательностей и тем самым ограничивает нецелевое редактирование.
Главное
- В среднем точность SpCas9 на ряде нецелевых участков увеличилась в 55 раз.
- РНК-шпильку добавляли на 5′-конец спейсера направляющей РНК.
- На целевых участках активность редактирования существенно не менялась.
- Эффект также наблюдали для SaCas9 и разных форм Cas12a.
- Эксперименты проводили с направляющими РНК для генов VEGFA и EMX1.
Подготовлено автоматически с помощью ИИ, возможны неточности. Полный просмотр материала доступен только для медицинских специалистов с высшим медицинским образованием.
Войти Регистрация