Гомозиготные участки ДНК: метод анализа проверили на двух породах свиней

Метод анализа гомозиготных участков ДНК разработали исследователи Донского государственного аграрного университета совместно с учеными Всероссийского научно-исследовательского института племенного дела. При разработке метода геномный анализ дополнили визуализацией и алгоритмами глубокого обучения нейросетей. Подход проверили на генетических данных свиней крупной белой породы и дюрок: модель классифицировала породы со стопроцентной точностью, а при прогнозировании дефектов конечностей у свиней крупной белой породы показала точность 78,6%.

Карты значимости помогли определить участки генома, которые влияют на прогноз модели. Авторы рассматривают метод как перспективный для оценки риска заболеваний у людей и животных, а также для идентификации пород. Карты значимости в настоящее время находятся на апробации в ведущих селекционно-племенных центрах; ученые планируют адаптировать метод для крупного рогатого скота и овец.