CpG-светофоры точнее отражают активность генов, чем метилирование их областей

Исследователи обнаружили, что метилирование CpG-светофоров точнее связано с активностью генов, чем метилирование промотора или тела гена в целом. CpG-светофорами называют отдельные CpG-динуклеотиды, метилирование которых связано с активностью расположенного рядом гена. Результаты исследования опубликованы в журнале BMC Genomics.

Команда также установила, что энхансеры — удалённые от генов регуляторные участки ДНК — содержат много CpG-светофоров, а сами эти позиции реже мутируют и сохраняются в ходе эволюции. Предполагаемый механизм, при котором метилирование меняет связывание факторов транскрипции, объясняет работу лишь небольшой части светофоров. Исследователи связывают их действие с состоянием хроматина, но конкретные механизмы ещё предстоит изучить. CpG-светофоры могут стать индикаторами активности генов в клинической практике: авторы отмечают, что оценка метилирования цитозинов надёжнее прямого измерения активности генов.